La Akademio enhavas Sekciojn, kiuj prizorgas diversajn lingvajn kampojn de la Akademia laboro. La Sekcioj ne estas fiksitaj, sed estas kreataj laubezone. Chiun Sekcion gvidas Direktoro. Chiu Akademiano povas aparteni al pluraj Sekcioj, lau sia intereso.
Nun (en Septembro 2007) ekzistas la jenaj Sekcioj:
| Sekcio | Direktoro |
|---|---|
| Faka Lingvo | Marc Bavant |
| Gramatiko | Jouko Lindstedt |
| Ghenerala Vortaro | Bertilo Wennergren |
| Konsultejo de la Akademio de Esperanto | Boris Kolker |
| Literaturo | Humphrey Tonkin |
| Prononco | Probal Das Gupta |
| Kontrolado de lerniloj | Marc Bavant |
La Akademio ankau havas Komisionojn, kiuj plenumas diversajn ne-lingvajn taskojn. Chiu Komisiono estas gvidata de Direktoro.
Nun (en Septembro 2007) ekzistas la jenaj Komisionoj:
| Komisiono | Direktoro |
|---|---|
| Historio de la Akademio de Esperanto | Carlo Minnaja |